Professor & Pesquisador

Dr. Rafael Vieira, Química Orgânica, Computacional & Machine Learning

Professor e pesquisador especializado em quimiometria, aprendizado de máquina e análise de produtos naturais, atuando na formação de novos pesquisadores na interseção entre química, estatística e ciência da computação.

Foto do Prof. Rafael Vieira
Projetos

Explore meu trabalho

Livros, plataformas e ferramentas desenvolvidas para pesquisa e ensino.

Livro

Aprendizado de Máquina no Reconhecimento de Padrões Moleculares

Abordagem completa combinando quimiometria e machine learning para análise de produtos naturais, com datasets e código-fonte reproduzível.

Acessar site →
Plataforma

Dynamic Dock

Plataforma para docking proteína-ligante e preparação de dinâmica molecular, com detecção automática de sítios ativos usando AutoDock Vina.

Acessar site →
Ensino

ENADE Química

Plataforma de revisão para o ENADE voltada a estudantes de Licenciatura em Química.

Acessar site →
Programas

RV_MASS

Plataforma RV_MASS (MOLECULAR ANALYSIS, STRUCTURE & SPECTRAL SIMULATION).

Acessar plataforma →
Extensão

RECICLA AÍ

(DIVULGAÇÃO DO PROJETO DA PROFA. DRA. JOCI NEUBY)

Lindo projeto de Extensão realizado pela profa. Dr. Joci Neuby.

Acessar site →
Disciplinas

Materiais de apoio às disciplinas

Plataformas de estudo com flashcards, quizzes e vídeo-aulas para os estudantes de Licenciatura em Química do IFRO.

Disciplina

Química Orgânica II/III

Plataforma de apoio com flashcards, quizzes e vídeo-aulas cobrindo condensações, reações de aminas, heterocíclicos e as principais técnicas espectroscópicas de elucidação estrutural.

Acessar disciplina →
Em breve: nova disciplina
Em breve: nova disciplina
Publicações

Produção científica

Uma seleção dos principais artigos publicados em periódicos internacionais. Perfil completo no ORCID.

In Silico Research in Biomedicine 2026

Dynamic Dock: A platform for automated molecular docking with active site detection and ligand replacement

Artigo que apresenta o Dynamic Dock, plataforma que automatiza o fluxo de docking molecular, detectando sítios ativos e substituindo ligantes automaticamente — a base científica por trás da ferramenta disponível no site do projeto.

Rafael Vieira; Kally Alves de Sousa
Next Research Set/2025

Exploring the molecular potential of natural products against COVID-19 through molecular modeling and machine learning

Investigação computacional que combina modelagem molecular e aprendizado de máquina para identificar produtos naturais com potencial de ação contra a COVID-19.

Rafael Vieira; Vitor Hugo Batista; Kally Alves de Sousa
Expert Systems with Applications Ago/2024

LUMIOS – Label using machine in organic samples – A software for dereplication, molecular docking, and combined machine and deep learning

Apresenta o LUMIOS, software que integra dereplicação, docking molecular e algoritmos de machine e deep learning para acelerar a identificação de compostos em amostras orgânicas.

Rafael Vieira; Kally Alves de Sousa; Ian Castro-Gamboa
Expert Systems with Applications Dez/2023

CHEIC: Chemical Image Classificator. An intelligent system for identification of volatiles compounds with potential for respiratory diseases using Deep Learning

Propõe o CHEIC, sistema inteligente baseado em Deep Learning para identificar, a partir de imagens químicas, compostos voláteis com potencial terapêutico para doenças respiratórias.

Rafael Vieira; Kally Alves de Sousa; Givaldo Souza da Silva; Dulce Helena Siqueira Silva; Ian Castro-Gamboa
Frontiers in Natural Products Set/2023

Twenty-five years of natural products research in NuBBE

Revisão coletiva que celebra 25 anos do NuBBE, banco de dados de referência em produtos naturais, destacando sua contribuição para dereplicação e pesquisa quimiotaxonômica no Brasil.

Helena Mannochio-Russo; Ana Letícia Pires dos Santos; Rafael Vieira; et al.
Archives of Microbiology Ago/2021

Induction of metabolic variability of the endophytic fungus Xylaria sp. by OSMAC approach and experimental design

Estudo que utiliza a abordagem OSMAC combinada a planejamento experimental para ampliar a variabilidade metabólica do fungo endofítico Xylaria sp., visando a descoberta de novos metabólitos bioativos.

Rafael Vieira; Kally Alves de Sousa; Afif Felix Monteiro; Luciano Silva Pinto; Ian Castro-Gamboa

Vamos conversar

Para colaborações acadêmicas, dúvidas sobre os projetos ou oportunidades de pesquisa.